近日，国际期刊《细胞通讯》在线发表了来自中国科学院动物研究所一研究团队及其合作者的论文。他们以斑马鱼尾部造血组织为研究对象，利用多重转录组测序，绘制了扩增性造血器官的3D转录组图谱，阐释了造血干细胞和微环境细胞之间的分子调控网络，为造血干细胞扩增的机制研究提供了更多启示。

  研究人员之所以选择斑马鱼尾部造血组织为解析对象，是由于其在功能上类似于哺乳动物的胎肝。他们采用了3种转录组测序方法，即特定类型群体细胞转录组、空间转录组和单细胞转录组，详细解析了斑马鱼尾部造血组织的时空特性。

  具体来说，空间转录组测序反映细胞位置信息，揭示了多种微环境因素对造血干细胞的不同调控方式，并实现了三维转录组重构斑马鱼造血器官；单细胞转录组数据更精细地阐释了尾部造血组织细胞类群、细胞特征及细胞间分子调控，并发现造血干祖细胞分化和细胞周期存在一定的关联性。同时，多重转录组测序综合分析揭示了造血干细胞在尾部造血组织的扩增受到内源性和外源性信号的共同调控，鉴定了新的造血干细胞的标记基因，发现了影响造血干细胞扩增的信号通路，完善了造血干细胞—微环境细胞间分子调控网络。

  此外，研究团队构建了斑马鱼尾部造血组织多重转录组数据库，可检索特定基因在造血组织的表达谱，包括基因表达的时间、细胞类型及相对空间位置。